華大基因聯手阿里云打破世界紀錄:僅用15分鐘完成個人全基因組測序

2020-01-17 21:40:10來源:威易網作者:

    1月17日,華大基因向外界宣布,在阿里云上搭建的BGI Online平臺創下了新的世界紀錄:僅用15分鐘,即可完成一個高精度的個人全基因組測序全流程。此前,科學界普遍需要120個小時才能完成類似流程,此次加速解碼意味著人類向精準醫療邁出了重要一步。

        15分鐘可以做什么?可能連一頓早餐都沒吃完。而云計算卻檢測出了人類基因上30億個堿基是如何排列的。
 
 
       1月17日,華大基因向外界宣布,在阿里云上搭建的BGI Online平臺創下了新的世界紀錄:僅用15分鐘,即可完成一個高精度的個人全基因組測序全流程。此前,科學界普遍需要120個小時才能完成類似流程,此次加速解碼意味著人類向精準醫療邁出了重要一步。
 
      個人全基因組測序(Whole Genome Sequencing,WGS)是迄今為止最為全面的基因組研究方案,可檢測出與人類疾病相關的單核苷酸變異、插入缺失、拷貝數變異和結構變異等多種全面的突變信息,使人類從根本上進一步認識疾病發生原因,為遺傳病檢測、腫瘤篩查等提供有力支撐,從而得到完整的人體“說明書”。
 
      好萊塢影星安吉麗娜·朱莉就通過WGS檢測出其攜帶了一個“錯誤”的基因——BRCA1,這讓她有87%的幾率患乳腺癌,50%的可能患卵巢癌。最終,朱莉通過乳腺切除手術,將乳腺癌患病風險從87%降到了5%。
 
       據悉,基于阿里云PB級的數據處理能力和容器服務ACK/AGS基因服務,以及賽樂基因GPU加速算法,華大基因實現了15分鐘內對7200億堿基拼裝、排序、去重、變異檢測,測試精度高達99.80%,相比經典流程提速了120倍,比此前全球最快的FPGA/GPU方案也快了4倍之多。
 
       1990年,整個人類基因組首次被測序,耗資27億。30年后的今天,得益于測序技術和云計算技術的成熟,一次全基因組測序的成本降到了數百美元,大大降低了人類解碼未知世界的門檻。
 
       由云計算掀起的計算革命,正在加速解碼生命天書。目前,國內70%以上的基因測序公司和研究機構都在使用阿里云的服務。此外,阿里云還同華大基因、英偉達、英特爾等合作加速精準醫療的普及,有望在一天內完成從樣本提取、基因測序、數據分析和診斷報告的輸出。
 

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